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你在迷人的地下通讯世界会使用哪种语言?

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你在迷人的地下通讯世界会使用哪种语言?

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你在迷人的地下通讯世界会使用哪种语言?


土壤中的生命

土壤是地球上最迷人和复杂的生态系统之一,它不仅是地球上植物生长 的地方,也是一个生活着许多生物的壮观且隐蔽的世界。土壤由不规则 的岩石块、小气孔和有机物(死去的植物和动物)组成,是微生物、昆 虫和植物生活的绝佳场所。你能相信土壤里充满了生命吗?根据土壤的 特点(岩石大小、食物种类、水分含量等),不同的生物体可以生活在 其中。这些不同的生物构建了一个特定的群落,一群独特的不同的生物 共同生活的地方。 你知道土壤微生物是什么吗?它们是附着在土壤颗粒或其他生物上生活 的非常微小的生物。有一些真菌,其形状类似于非常细的根,因此它们 可以与邻居接触并交换信息;还有细菌,这是一种由单细胞组成的生 物,通常只有使用显微镜才能看到。如果这些微生物生活在根际(植物 根部周围的土壤),就被称为根际微生物,它们可以生活在根表面或根 内部[1]。在根际,你可以找到帮助植物生存和生长的有益微生物,或者 攻击植物并使其生病的有害微生物。

土壤微生物和植物是如何交流的?

土壤微生物相互之间能进行交流,也能与其他生物(如植物和动物)进 行交流。许多科学家已经对微生物和植物之间的交流进行了研究。这种 交流是建立在使用分子作为语言的基础上的,被称为化学交流。你可以 把一个分子想象成一群相互连接的小球(原子)。这些原子是重要的化 学碎片,像碳(C)、氢(H)、氧(O)和氮(N),它们连接在一起 (像拼图一样)形成水(H O)或二氧化碳(CO )等分子。原子的特 2 2 定组合创造了具有不同性质的分子。 土壤微生物可以产生许多类型的分子,可以分为两大类:可溶性分子和 挥发性分子。可溶性分子溶于水(就像茶中的方糖),通过水在土壤中 进行运输,用于和生长在微生物附近的植物进行交流。挥发性分子,也 称为挥发性有机化合物(VOCs),这些挥发性化合物是气体,很容易 通过土壤的气孔进行传播,可用于远距离交流(图1)。植物的根部可 以闻到这些气体,就像你的鼻子可以闻到花香或新鲜出炉的面包[1]。 化学交流不是只从微生物到植物单向发生,而是双向的——植物也可 以产生信号分子传递给微生物。

通信分子有什么作用?

下面是一些例子,说明当微生物和植物开始相互交流时会发生什么。

1、植物和微生物相互帮助获取食物

许多土壤微生物使植物更容易获得必要的营养,从而帮助植物生长。例 如,根瘤菌可以将空气中的氮气(N )转化为氨(NH ),这种转化

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被称为固氮作用,发生在土壤中。固氮作用对植物非常重要,因为它们 需要氮来生长,但它们只能从土壤中吸收NH 形态的氮。通过将N 转

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化为NH ,根瘤菌能够帮助植物生长,使它们变得更强壮!

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更有趣的是,根瘤菌可以与特定的植物(如大豆和豌豆)对话。这种对 话是如何进行的呢?首先,植物向根际释放异黄酮分子,这种分子可以 吸引根瘤菌;这些细菌 “听到”植物的 “对话”,并向它走去;在走 向植物的过程中,根瘤菌开始产生结瘤因子,这些分子告诉植物在根部 创造一个使根瘤菌能够在其间生活的空间,这个空间称为根瘤。作为对 植物栖息地和食物(糖)的交换,根瘤菌给植物提供大量的NH (图

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2)。对植物和根瘤菌来说,共同生活是一种优势,因为这两种生物都 比它们单独生活时能够获得更多的食物,因此它们可以更好地生长[2]。

2、微生物可以帮助植物免受病原体和害虫的侵害

生物因素是环境中的生物部分,如植物、动物和微生物(图3)。生物 性胁迫是生物体感受到的压力,比如植物被生物因素(如被称为病原体 的有害微生物或被称为害虫的有害昆虫)破坏。有益微生物可以通过两 种方式帮助植物对抗病原体和害虫:第一种方法是微生物可以把病原体 或害虫赶走或杀死。例如,一些有益微生物产生的VOCs可以阻止病原 体的生长或害虫对植物的攻击。第二种方法是告诉植物通过增加其防御 能力来做好战斗准备。你的妈妈可能也会在冬天告诉你要多吃橙子,因 为橙子含有维生素C,它能够提高你的免疫防御能力,保护你免受疾病

的伤害。微生物和植物的机制也是一样的,比如荧光假单胞菌

(Pseudomonas fluorescens)产生的分子可以使植物更好地抵御病 原体的攻击[3]。

3、微生物可以帮助植物在艰苦地区生存

非生物因素是环境中的非生物部分,包括阳光、温度和水(图3)。非 生物胁迫是指这种因素对生物体的负面影响。例如低含量可用水和高含 量盐等都是对植物有害的非生物胁迫。有益微生物可以帮助植物在生活 条件恶劣的艰苦地区生存。例如,绿针假单胞菌O6(Pseudomonas chlororaphis O6)可以使一些植物在水分不足的情况下存活下来 [4]; 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)通过减少进入植物根部的盐分,帮助 植物在含盐量高的土壤中生存[5]。

为什么了解化学交流很重要?

微生物和其他生物之间的化学交流在数百万年前就开始进化了。4.5亿年 前,植物开始从海上迁徙到陆地上生活。科学家们认为,土壤真菌是最 早帮助植物实现在陆地上生存的生物。真菌帮助植物利用重要的营养物 质,使植物能够存活[6]。因此数百万年来,土壤生物之间的化学交流对 植物的健康和生长一直很重要。在这篇文章中,我们解释了植物-微生物 的相互作用如何为植物提供更多的食物,或帮助植物对抗病原体或在艰 苦地区生存。不幸的是,这些相互作用正处于危险之中!在农业中大量 使用抗生素、杀虫剂和化肥会改变土壤,同时也会改变土壤群落,导致 一些土壤生物死亡,另一些土壤生物生长。微生物群落的变化(比如作

为病原体的微生物的生长)可能会对植物产生可怕的影响!

人类人口仍在增长,由于人们需要食物来生存,所以必须找到新的方法 来增加植物生长和食物产量[2]。微生物越来越多地被用作促进植物生长 和粮食生产的天然助手。研究微生物与植物之间的交流对于了解哪些微 生物可以帮助植物生长是必要的,我们必须密切关注并选择正确的微生 物!例如,你可能认为使用镰刀菌(Fusarium culmorum)是一个好方 法,因为它有助于某些植物在含盐量高的艰苦地区生长;但是镰刀菌是 一种对玉米有害的病原菌!出于这些原因,研究人员希望尽可能多地了 解化学交流,以增加我们对土壤生态系统的认识,了解生物如何在这些 生态系统中相互作用,并帮助我们利用植物与微生物的相互作用在保护 土壤生态系统的同时增加植物的生长以获得食物。

Figures

Figure 1: Plant-microbe interactions in the rhizosphere. Figure 1: 根际植物-微生物的相 互作用。图片显示了3 种类型的相互作用: (A)在可溶性分子的 帮助下,植物与生活在 根部表面或附近的微生 物之间的相互作用; (B)在挥发性分子的 帮助下,植物与生活在 远离根部的微生物之间 的相互作用; (C)植物与生活在根 部内部的微生物(直接 接触根细胞)的相互作 用。这些相互作用发生 在由岩石、气孔和有机 物组成的土壤中。

Figure 2: The effects of plant-Rhizobium interactions on root structure. Figure 2: 植物-根瘤菌相互作用 对根系结构的影响。 (A)正常的根系结构 和化学交流的开始。首 先植物产生异黄酮 (1),然后根瘤菌通 过产生结瘤因子(2) 进行反应。(B) 根瘤 菌向根部移动,粘在根 毛上,然后根毛改变形 状使细菌能进入根部。 (C)根瘤的形成,这 是细菌繁殖、糖和氮被 交易的空间。 生物因素 环境中的生物成分,如 植物、动物和微生物。 非生物因素 环境中的非生物成分, 如岩石、阳光和水。

Figure 3: Important biotic factors and abiotic factors that interact in the environment. Figure 3: 在环境中相互作用的重 要的生物因素和非生物 因素。它们可以影响植 物的生长以及植物和土 壤微生物之间的化学交 流。 Ariotti et al. 参考文献 [1] van Dam, N. M., Weinhold, A., and Garbeva, P. 2016. Calling in the dark: the role of volatiles for communication in the rhizosphere. ISME J. 12:1252–62. doi: 10.1007/978-3-319-33498-1_8 [2] Tomer, S., Suyal, D. C., and Goel, R. 2016. “Biofertilizers: a timely approach for sustainable agriculture,” in Plant-Microbe Interaction: An Approach to Sustainable Agriculture, eds D. Choudhary, A. Varma, and N. Tuteja (Singapore: Springer). p. 375–95. doi: 10.1007/978-981-10-2854-0_17 [3] Van Wees, S. C. M., Van der Ent, S., and Pieterse, C. M. J. 2008. Plant immune responses triggered by beneficial microbes. Curr. Opin. Plant Biol. 11:443–8. doi: 10.1016/j.pbi.2008.05.005 [4] Garbeva, P., and Weisskopf, L. 2020. Airborne medicine: bacterial volatiles and their influence on plant health. New Phytol. 226:32–43. doi: 10.1111/nph.16282 [5] Ortíz-Castro, R., Contreras-Cornejo, H. A., Macías-Rodríguez, L., and López-Bucio, J. 2009. The role of microbial signals in plant growth and